La mission Holy Cross et le territoire non cédé de Wiikwemkoong (ou Wikwemikong) sont situés sur l’île Manitoulin, également connue sous le nom de Mnidoo Mnis ou Odawa Mnis. Avant l’arrivée des Européens, la confédération Anishinaabek composée des Odawas, des Ojibwés et des Potawatomi contrôlait les régions nordiques des Grands Lacs, y compris l’île Manitoulin. Le père Joseph Poncet, SJ, fut le premier Européen à fouler le sol de l’île, en 1648. Il fut le seul jésuite à exercer son ministère sur l’île jusqu’en 1844, date à partir de laquelle les jésuites revinrent et poursuivirent leur ministère.
Holy Cross est la plus ancienne église catholique du nord de l’Ontario. Sa construction débuta en 1849 et elle fut officiellement consacrée en 1852. Tous les travaux de maçonnerie pendant la construction ont été réalisés par des membres de la Nation Anishinaabe. En 1850, un moulin communautaire a été utilisé pour couper du bois en planches pour l’équipe de construction de l’église. Les principaux constructeurs de l’église Wiikwemkoong étaient les familles Bemanakinong, Wakegijig, Gabow et Kenogameg (Kinoshameg).
En 1954, l’église ainsi que la salle et la résidence attenantes ont été détruites par un incendie. Seuls les murs de pierre de l’église et de la résidence (aujourd’hui appelée « les Ruines ») sont restés debout. Immédiatement après cette tragédie, les hommes d’affaires et les commerçants locaux de Wiikwemkoong ont planifié, financé et reconstruit l’église.
Outre l’église Holy Cross, il existe trois autres églises catholiques à Wiikwemkoong. L’église Our Lady of Grace, à South Bay, a été construite en 1910 et a donc célébré son centenaire en 2010. Une collecte de fonds est en cours et des travaux de rénovation ont commencé pour cette belle et ancienne église en pierre. L’église actuelle de Kaboni, St. Anthony Daniel, a été construite vers 1953. L’église Saint-Ignace (Gchitwaa Niyaanhs) a été construite en 1975, en remplacement d’une église plus ancienne dans la communauté locale de Buzwah.
Les églises de Wiikwemkoong contiennent un mélange d’art européen et autochtone, notamment des peintures et des sculptures d’artistes locaux tels que Zoey Wood-Salomon, James Jacko et Nikki Manitowabi. Les vêtements liturgiques portés par les prêtres et les diacres sont en cuir et ont été fabriqués par des artisans locaux. L’église locale d’aujourd’hui s’efforce de promouvoir la réconciliation et l’inculturation, c’est-à-dire l’intégration de la culture locale non seulement dans les œuvres d’art et les vêtements liturgiques, mais aussi dans la liturgie de la messe et d’autres services de prière.